PCR仪(基因扩增仪)一般有四种类型分别是普通基础PCR仪，实时荧光定量PCR仪梯度PCR仪和原位PCR仪。这四种PCR仪的一般原理有相似的地方但在结构和配件方面还存在一些差异。
(1)普通基础PCR仪由主机加热模块PCR管样品基座热盖控制软件组成。
(2)实时荧光定量PCR仪在普通PCR仪的基础上增加一个荧光信号采集系统和计算机分析处理系统。荧光检测系统主要包括激发光源和检测器。激发光源有卤钨灯光源、氩离子激光器、发光二极管LED光源前者可配多色滤光镜实现不同激发波长而单色发光二极管LED价格低、能耗少、寿命长不过因为是单色需要不同的LED才能更好地实现不同激发波长。监测系统有超低温CCD成像系统和PMT光电倍增管前者可以一次对多点成像后者灵敏度高但一次只能扫描一个样品，需要通过逐个扫描实现多样品检测对于大量样品来说需要较长的时间。
(3)梯度PCR仪除具有普通PCR仪的结构外还具有特殊的梯度模块可实现对梯度温度和梯度时间等参数的调整。因此可以在一次实验中对不同样品设置不同的退火温度和退火时间从而可在短时间内对PCR实验条件进行优化提高PCR科研效率。
(4)原位PCR仪与普通PCR仪相比，振动分析仪用玻片代替了PCR管其反应过程是在载玻片的平面上进行的。
